7月2日晚，香港銅鑼灣書店店長林榮基在台北馬偕醫院病逝，享壽70歲。台灣陸委會、文化部及文化部長李遠等人紛紛表達哀悼，肯定他長期堅持出版自由、民主與人權理念，並認為他在台灣重啟銅鑼灣書店，對促進港台文化交流及自由思想傳播具有重要意義。

7月2日晚，台灣陸委會發表聲明稱，對於林榮基辭世深感不舍與哀悼，後續將協助家屬及台灣基督長老教會牧師黃春生處理相關後事。

陸委會指出，林榮基曾在2015年香港銅鑼灣書店事件中遭中共長期拘留，之後，他公開講述自身經歷，並在《港區國安法》實施前移居台灣，重新創辦銅鑼灣書店，使其成為自由與出版精神的重要象徵。

聲明表示，林榮基始終認同台灣民主、自由、人權等核心價值，也多次提醒外界，自由並非理所當然，「有些東西不是垂手可得」，需要社會共同珍惜與維護。

陸委會還表示，林榮基熱愛台灣、支持民主自由的精神，值得社會肯定與懷念。

7月3日，陸委會主委邱垂正接受廣播節目專訪時透露，7月2日中午，共同友人黃春生牧師通知，林榮基已進入彌留狀態，陸委會人員隨後趕赴醫院探視。他說，陸委會長期與林榮基保持聯繫，今年6月探望時，林榮基表示，他的身體狀況正在持續惡化。

邱垂正還稱，林榮基曾說，自己經營書店並非只是賣書，而是希望傳播書中的理念。他經常向年輕人分享自由、民主、人權和法治等普世價值，並提醒大家珍惜這些得來不易的權利。

邱垂正回憶，林榮基曾感慨，香港未能守住原有的自由與民主，因此希望台灣社會能夠共同守護民主生活方式。他表示，悼念林榮基，不僅是緬懷一位出版人，更應學習他堅持自由價值的精神。

文化部長李遠也於當天發表聲明稱，今年4月曾前往位於台北市金門街的銅鑼灣書店探望林榮基。當時雙方曾討論，希望結合附近紀州庵文學森林、廈門街舊書店等文化據點，共同推動「金同廈文學森林計劃」，串聯周邊獨立書店，打造新的文化交流空間。文化部返部後已著手規劃相關構想，沒想到計劃仍在研議階段，林榮基便已離世，讓他深感悲傷與遺憾。

他說，「我們真的是晚了一步」。

李遠指出，林榮基選擇在台灣重新掛起銅鑼灣書店的招牌，對台灣具有特殊意義。尤其是2019年香港反送中運動後，書店持續關注香港、中國及政治議題，成為許多在台港人交流的重要場所。

文化部表示，林榮基一生以書為業，也以行動守護閱讀自由與思想自由。面對威權壓力，他始終堅持出版自由理念，不僅見證香港出版環境的重要變化，也讓國際社會更加關注言論自由與人權價值所面臨的挑戰。他來台後重新開設銅鑼灣書店，讓其成為台灣與香港文化交流及自由思想對話的重要空間。

林榮基因香港銅鑼灣書店事件受到國際關注。

2015年，銅鑼灣書店因銷售涉及中國政治人物的書籍，多名負責人及員工先後失蹤，林榮基就是當事人之一。這一事件引發國際社會對於香港出版自由和言論自由的廣泛關注。

移居台灣後，林榮基於台北重新經營銅鑼灣書店，初期曾設於中山區，後遷址至中正區金門街持續營運。

林榮基去年接受媒體訪問時曾表示，只要站在自由的土地上，就能夠找到生活。他強調，健康與自由是人生最重要的事情。

他坦言，經營書店雖然壓力不小，但賣書並非唯一目的，更希望書店能夠成為人與人交流、推動閱讀，促使社會反思現實的重要空間。