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台灣大約有50人因設籍中國或領用護照事證明確，其台灣戶籍已被戶政機關廢止。陸委會主委邱垂正11月4日表示，兩岸條例規定台灣人民不得申領大陸戶籍、護照，且要有嚴肅的證據，經過一定程序確定有申領對岸身分，才會註銷戶籍資料、台灣身分。 中央社報導，內政部移民署11月2日表示，針對疑似在大陸設籍、領用中國身分證或中國護照的台灣人，經相關機關通報或民眾檢舉後，均會依法展開調查。截至目前，已因事證明確而通報戶政機關廢止約50人的台灣戶籍。 移民署強調，此舉係配合總統賴清德針對台灣面對五大國安及統戰威脅提出的17項因應策略，持續清查違規行為。 內政部長劉世芳先前指出，一旦查獲國人持有中國身分證，將註銷其台灣身分證，並同步通報外交部、移民署及戶政單位等，取消其健保、身分證與護照等權利。 今年8月，內政部預告修正「在台原有戶籍大陸地區人民申請回復台灣地區人民身分許可辦法」修正草案，明定曾因領用中國護照或在大陸設籍而喪失台灣身分的民眾，欲申請回復時，須符合三大情況之一：對台灣國防安全、國際形象或社會安定有重大特殊貢獻；有助台灣整體利益；或基於人道考量。 此外，修正草案亦規定，若現在或曾為中共從事任何政治性宣傳者，得不予或撤銷回復台灣身分的許可。 另一方面，政府要求約1.2萬名在台定居的原中國籍人士補交「喪失原籍證明」。移民署表示，截至10月29日，已有7835人繳附證明、2317人經同意具結或延期、1388名長期出境者列冊管理，整體處理進度達95.1%。專案期間，亦有16名陸配主動放棄台灣身分，理由包含在大陸享有社福、財產繼承或配偶過世等，政府尊重其個人意願。