7月2日晚，香港铜锣湾书店店长林荣基在台北马偕医院病逝，享寿70岁。台湾陆委会、文化部及文化部长李远等人表达哀悼，称他长期坚持出版自由、民主与人权理念，并认为他在台湾重启铜锣湾书店，为港台文化交流及自由思想留下重要意义。

7月2日晚，台湾陆委会发表声明称，对于林荣基辞世深感不舍与哀悼，后续将协助家属及台湾基督长老教会牧师黄春生处理相关后事。

陆委会指出，林荣基曾在2015年香港铜锣湾书店事件中遭中共长期拘留，之后，他公开讲述自身经历，并在《港区国安法》实施前移居台湾，重新创办铜锣湾书店，使其成为自由与出版精神的重要象征。

声明表示，林荣基始终认同台湾民主、自由、人权等核心价值，也多次提醒外界，自由并非理所当然，“有些东西不是垂手可得”，需要社会共同珍惜与维护。

陆委会还表示，林荣基热爱台湾、支持民主自由的精神，值得社会肯定与怀念。

7月3日，陆委会主委邱垂正接受广播节目专访时透露，7月2日中午，共同友人黄春生牧师通知，林荣基已进入弥留状态，陆委会人员随后赶赴医院探视。他说，陆委会长期与林荣基保持联系，今年6月探望时，林荣基表示，他的身体状况正在持续恶化。

邱垂正还称，林荣基曾说，自己经营书店并非只是卖书，而是希望传播书中的理念。他经常向年轻人分享自由、民主、人权和法治等普世价值，并提醒大家珍惜这些得来不易的权利。

邱垂正回忆，林荣基曾感慨，香港未能守住原有的自由与民主，因此希望台湾社会能够共同守护民主生活方式。他表示，悼念林荣基，不仅是缅怀一位出版人，更应学习他坚持自由价值的精神。

文化部长李远也于当天发表声明称，今年4月曾前往位于台北市金门街的铜锣湾书店探望林荣基。当时双方曾讨论，希望结合附近纪州庵文学森林、厦门街旧书店等文化据点，共同推动“金同厦文学森林计划”，串联周边独立书店，打造新的文化交流空间。文化部返部后已着手规划相关构想，没想到计划仍在研议阶段，林荣基便已离世，让他深感悲伤与遗憾。

他说，“我们真的是晚了一步”。

李远指出，林荣基选择在台湾重新挂起铜锣湾书店的招牌，对台湾具有特殊意义。尤其是2019年香港反送中运动后，书店持续关注香港、中国及政治议题，成为许多在台港人交流的重要场所。

文化部表示，林荣基一生以书为业，也以行动守护阅读自由与思想自由。面对威权压力，他始终坚持出版自由理念，不仅见证香港出版环境的重要变化，也让国际社会更加关注言论自由与人权价值所面临的挑战。他来台后重新开设铜锣湾书店，让其成为台湾与香港文化交流及自由思想对话的重要空间。

林荣基因香港铜锣湾书店事件受到国际关注。

2015年，铜锣湾书店因销售涉及中国政治人物的书籍，多名负责人及员工先后失踪，林荣基就是当事人之一。这一事件引发国际社会对于香港出版自由和言论自由的广泛关注。

移居台湾后，林荣基于台北重新经营铜锣湾书店，初期曾设于中山区，后迁址至中正区金门街持续营运。

林荣基去年接受媒体访问时曾表示，只要站在自由的土地上，就能够找到生活。他强调，健康与自由是人生最重要的事情。

他坦言，经营书店虽然压力不小，但卖书并非唯一目的，更希望书店能够成为人与人交流、推动阅读，促使社会反思现实的重要空间。