美国联邦政府宣布冻结哈佛大学超过22亿美元研究经费后，哈佛于周一（4月21日）正式对川普政府提起诉讼，要求联邦法院解冻数。美国100多所高校也在第二天联合谴责政府干预学术、滥用科研经费施压，破坏法治与学术自由。
综合美联社、法新社报导，哈佛在向波士顿联邦法院提交的诉讼中写道，这一冻结决定“武断且反复无常”，不仅缺乏与“反犹主义”之间的合理联系，也未考虑其对科研、公共利益及国家创新的重大影响，严重侵犯了学校的《第一修正案》权利，并违反了《民权法案》第六章禁止歧视的条款。
白宫发言人哈里森·菲尔兹（Harrison Fields）则在邮件中反击称：“ 像哈佛这样的机构长期依赖联邦资助，用纳税人、特别是经济拮据的美国家庭的税金，养肥那些高薪官僚，这样的好日子到头了。”菲尔兹表示，纳税人的资金是一种特权，而哈佛未满足享受这一特权的基本条件。
川普政府此前以该校拒绝终止多元、公平与包容（DEI）政策及未能有效遏止校园反犹主义为由，冻结相关资金。
而在媒体披露川普政府计划进一步冻结哈佛大学约10亿美元资金后不久，哈佛提起了诉讼。若该计划实施，川普政府对这所常春藤名校的资金冻结将累计高达32亿美元。《华尔街日报》于周日（20日）援引知情人士的消息，披露了事件的最新进展。
此次新增冻结的10亿美元资金主要用于医疗研究。而在上周，川普政府已冻结22.6亿美元预算，并威胁撤销哈佛的大学免税地位。不过，白宫方面尚未详细说明本次追加冻结资金的具体理由。
哈佛大学校长艾伦·贾伯（Alan Garber）21日在声明中指出：“政府的过度干预将带来严重且长远的影响。被迫中止的研究项目，包括了提升儿童癌症幸存者生活品质、探究癌症扩散的分子机制、预测传染病爆发，乃至协助战场负伤士兵减轻痛苦的技术。”
在哈佛大学起诉川普政府的次日，包括常春藤盟校普林斯顿大学和布朗大学在内的100多所美国高校发表联合声明，谴责川普对教育体系的“政治干预”。
联署信中写道：“我们欢迎建设性的改革，也不反对合法的政府监督。但我们必须坚决反对不当的政府介入，”信中补充道，“我们必须拒绝以公共科研资金作为施压手段。”
在前一段时间，川普指控多所知名大学纵容校园反犹太主义，并以此为由威胁削减其预算、取消免税资格，甚至限制其招收国际学生。
包括哥伦比亚大学在内的多所顶尖高校，已在某种程度上遵守川普政府的要求。川普政府认为美国高校的精英群体过于偏左。